近50年來，我館研究人員在社會(huì)科學(xué)與自然科學(xué)研究領(lǐng)域取得了一定成果，多次榮獲省、部級(jí)獎(jiǎng)項(xiàng)，出版各種專題研究20多種，發(fā)表在國(guó)內(nèi)外學(xué)術(shù)刊物的論文數(shù)百篇。
編輯出版的論文集、專著有：
吳文良著：《泉州宗教石刻》(考古學(xué)專刊,乙種第七號(hào))，科學(xué)出版社1957年。
福建省泉州海外交通史博物館等編：《泉州伊斯蘭教研究論文集》，福建人民出版社1983年。
福建省泉州海外交通史博物館編：《泉州灣宋代海船發(fā)掘與研究》，海洋出版社1987年。
福建省泉州海外交通史博物館編：《泉州伊斯蘭教石刻》（主撰陳達(dá)生），寧夏人民出版社、福建人民出版社1984年。
《中國(guó)與海上絲綢之路》（聯(lián)合國(guó)教科文組織海上絲綢之路綜合考察泉州國(guó)際學(xué)術(shù)討論會(huì)論文集，上下冊(cè)），福建人民出版社1991年、1994年。
王連茂等著：《閩臺(tái)關(guān)系族譜資料匯編》，廈門大學(xué)出版社1987年。
王連茂等著：《海上絲綢之路著名港口——泉州》，海洋出版社1988年。
李玉昆著：《泉州海外交通史略》，廈門大學(xué)出版社1995年。
王連茂、葉恩典整理：《張士箱家族文件匯編》，福建人民出版社1999年。
王連茂、陳麗華著：《中華海洋文化的縮影—泉州海外交通史博物館》，中國(guó)大百科全書出版社1999年。
王連茂、丁毓玲著：《重返<光明之城>》圖冊(cè)，福建人民出版社2000年。
陳麗華等：《泉州海關(guān)志》（古代市舶司篇）2005年，廈門大學(xué)出版社。
李玉昆、李秀梅：《泉州古代海外交通史》，2007年，中國(guó)廣播電視出版社。
陳麗華著：《鐵觀音——安溪烏龍茶傳統(tǒng)制作技藝》，2012年，浙江人民出版社。
王麗明整理：《跨越海洋》，2012年，寧波出版社。
泉州海外交通史博物館編：《唐船圖考證、中國(guó)船、中國(guó)木帆船》，2013年，海洋出版社。
楊條沯著：《設(shè)計(jì)師筆記》，2015年，中國(guó)藝術(shù)家出版社。
以及部分非正式出版資料，如：《泉州海交史資料選輯》（1960年）、《古船資料輯錄》（1973年）、《泉州灣古船研究動(dòng)態(tài)》（1975年）、《泉州港與古代海外交通》（1982年）、 《泉州港與古代海外交通》、王洪濤《晚蠶集》、《瓷器概述》、《晉江、安海、圍頭、石湖等地海外交通史調(diào)查》、《泉州海外交通史跡調(diào)查資料》、《泉州灣古船研究動(dòng)態(tài)》、 《泉州海外交通史料匯編》等。
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